Folge 1: Untiefen
Ein ungeklärter Doppelmord wirft viele Jahre später erneute Fragen auf und führt zu einem weiteren Verbrechen. Die Suche nach den wahren Hintergründen dieser Ereignisse schildert die sechsteilige Krimi-Serie "Blackwater – Im Schatten der Vergangenheit". Die deutsch-schwedisch-dänische Koproduktion basiert auf dem vielfach mit Literaturpreisen ausgezeichneten Erfolgsroman der schwedischen Schriftstellerin Kerstin Ekman.
Folge 2: Dunkle Spur
Die Lehrerin Annie, vor fast 20 Jahre wichtigste Zeugin bei einem ungeklärten Doppelmord, ist verschwunden. Als ihr Partner, der Landarzt Birger, feststellt, dass auch Annies Schrotflinte fehlt, schrillen bei ihm die Alarmglocken. Er erinnert sich noch an den Sommer 1973, als Annie die zwei Leichen entdeckte. Während sie danach mit ihrer achtjährigen Tochter Mia zu ihrem Freund Dan in eine Hippiekommune zog, nahm die Polizei die Mordermittlungen in Blackwater auf. Auch Birger geriet unter Verdacht. Die verhängnisvolle Mordnacht hatten er und Kommissar Åke gemeinsam unweit vom Tatort verbracht.
Folge 3: Gegen den Strom
Sommer 1973. Nur langsam gewöhnt sich Annie mit ihrer sechsjährigen Tochter Mia an das beengte Leben bei ihrem Freund Dan in der Hippiekommune. Insbesondere mit Kommunengründer Petrus gerät Annie wiederholt aneinander. Unterdessen sorgt sich Gudrun Brandberg um ihren verschwundenen Sohn Johan. Der 17-jährige Ausreißer versteckt sich bei der geheimnisvollen Ylja. Hatte er etwas mit dem Mord an den beiden Touristen in Blackwater zu tun?
Folge 4: Zeitenwechsel
Annie beginnt nach ihrem Umzug in die Kommune, die Kinder zu unterrichten. Dort tauchen zwei Ermittler auf, die in dem ungeklärten Mordfall nun Dan vernehmen. Auch Annie zweifelt, dass er die ganze Wahrheit über seinen Verbleib in der Tatnacht sagt. Dan weicht ihr jedoch aus.
Unterdessen bricht der Ausreißer Johan in das Haus seiner geheimnisvollen Helferin Ylja ein. Dort macht er eine Entdeckung, die seine Abhängigkeit noch weiter steigert.
Folge 5: Verschlungene Pfade
Der ungeklärte Mord an zwei Touristen lässt Birger auch nach fast 20 Jahren keine Ruhe. Gemeinsam mit Johan fährt er zu dem damaligen Ermittler Åke, der sie auf eine neue Spur bringt. Obwohl Johan nie zu dem Kriminalfall vernommen wurde und der Mörder sein könnte, reist Birger mit ihm zusammen nach Finnland. Dort hofft er endlich herauszufinden, wer das unidentifizierte zweite Opfer im Zelt war. Unterdessen trifft sich Mia mit dem Waldarbeiter Björne, um mit ihm über ihre Mutter zu sprechen. Zwar weiß sie wenig über den Einsiedler, dennoch vertraut sie ihm etwas sehr Privates an.
Folge 6: Nach dem Schweigen
Stockholm, 1991. Birger und Johan suchen den Ex-Freund von Annie auf. Die beiden hoffen, von dem in die Jahre gekommenen Hippie Dan mehr über das zweite Todesopfer aus der Mitsommernacht 1973 zu erfahren. Birger will Dan zudem mit einer schmerzhaften Schuld konfrontieren. Birger und Johan fahren zurück in Schwedens Norden. Sie glauben jetzt zu wissen, wo sie den Mörder von damals suchen müssen. Gerade als Birger glaubt, die ganze Wahrheit zu kennen, nimmt die Aufklärung des Mordfalls jedoch eine unerwartete Wendung.